세포투과펩타이드는 세포막을 쉽게 침투할 수 있는 작은 펩타이드입니다.이러한 종류의 분자, 특히 표적화 기능을 갖춘 CPP는 표적 세포에 효율적인 약물 전달을 약속합니다.
따라서 이에 대한 연구는 특정한 생의학적 중요성을 가지고 있습니다.본 연구에서는 서로 다른 막횡단 활성을 갖는 CPP를 서열 수준에서 연구하여 CPP의 막횡단 활성에 영향을 미치는 요인, 서로 다른 활성을 갖는 CPP와 NonCPP 간의 서열 차이를 찾아보고 생물학적 서열을 분석하는 방법을 소개하고자 한다.
CPPs 및 NonCPPs 서열은 CPPsite 데이터베이스 및 다양한 문헌에서 얻었으며, CPPs 서열에서 막횡단 활성이 높고, 중간이고, 낮은 막횡단 펩타이드(HCPP, MCPP, LCPP)를 추출하여 데이터 세트를 구성했습니다.이러한 데이터 세트를 기반으로 다음과 같은 연구가 수행되었습니다.
1, 다양한 활성 CPP와 NonCPP의 아미노산 및 2차 구조 조성을 ANOVA로 분석했습니다.아미노산의 정전기적 및 소수성 상호작용은 CPP의 막횡단 활성에 중요한 역할을 하며, 나선형 구조와 무작위 코일링도 CPP의 막횡단 활성에 영향을 미치는 것으로 밝혀졌습니다.
2. 다양한 활성을 갖는 CPP의 물리적, 화학적 특성과 길이가 2차원 평면에 표시되었습니다.서로 다른 활동을 하는 CPP와 NonCPP는 일부 특별한 속성 아래에 클러스터될 수 있으며 HCPP, MCPP, LCPP 및 NonCPP는 세 개의 클러스터로 나누어 차이점을 보여줍니다.
3. 본 논문에서는 생물학적 서열의 물리적, 화학적 중심 개념을 도입하고, 서열을 구성하는 잔기를 입자점으로 간주하고, 서열을 입자계로 추상화하여 연구한다.이 방법을 PCA 방법으로 서로 다른 활동을 하는 CPP를 3차원 평면에 투사하여 CPP 분석에 적용한 결과, 대부분의 CPP가 함께 클러스터링되고 일부 LCPP는 NonCPP와 클러스터링되는 것으로 나타났습니다.
본 연구는 CPP 설계와 다양한 활동에 따른 CPP 순서의 차이를 이해하는 데 시사점을 갖습니다.또한, 본 논문에서 소개한 생물학적 서열의 물리적, 화학적 중심 분석 방법은 다른 생물학적 문제의 분석에도 사용될 수 있다.동시에 일부 생물학적 분류 문제의 입력 매개변수로 사용될 수 있으며 패턴 인식에 중요한 역할을 할 수 있습니다.
게시 시간: 2023년 6월 15일